Формирование нумизматической коллекции НГ МАУК «Музейный комплекс» началось в первые годы существования музея в городе Нефтеюганске из переданных в дар отдельных предметов и небольших коллекций. Сегодня нумизматическая коллекция содержит около двух тысяч единиц хранения. Большую ее часть составляют российские монеты, от старинных до современных. В составе собрания — медные и серебряные монеты, датируемые  XVII веком, русские монеты XIX-XX веков. Имеется небольшой фонд иностранных монет и раздел «Бонистика» — бумажных денежных знаков.

В раздел «Фалеристика» входят памятные медали, ордена, знаки. Они принадлежали выдающимся личностям, знаменитым землякам, ветеранам Великой Отечественной войны. Уникальными экспонатами коллекции также  стали значки советского периода с соответствующей символикой, значки об истории развития судостроения в России, значки со спортивной и школьной тематикой. Много знаков и значков на городскую тематику – к юбилеям города Нефтеюганска, предприятий и организаций, а также значки-логотипы различных мероприятий.